Unter dem Vorsitz von Valérie Pécresse, auch Präsidentin der Region Île-de-France, setzt sich der Verwaltungsrat aus lokalen Mandatsträgern (Region, Departement und Stadt Paris) zusammen. Er stimmt über die Maßnahmen ab, die das ordnungsgemäße Funktionieren des Netzes von Île-de-France Mobilités und dessen schrittweise Modernisierung gewährleisten sollen.
Île-de-France Mobilités besteht aus mehr als 400 Mitarbeitern unter der Leitung von Laurent Probst, ihrem Geschäftsführer.