Der Verwaltungsrat unter dem Vorsitz von Valérie Pécresse, die auch Präsidentin der Region Île-de-France ist, setzt sich aus lokalen Mandatsträgern (Region, Departement und Stadt Paris) zusammen. Er stimmt über Maßnahmen ab, mit denen das ordnungsgemäße Funktionieren des Netzes der Île-de-France Mobilités und seine schrittweise Modernisierung sichergestellt werden sollen.
Île-de-France Mobilités besteht aus mehr als 400 Mitarbeitern unter der Leitung von Laurent Probst, dem Geschäftsführer.