Presieduto da Valérie Pécresse, anche Presidente della Regione Île-de-France, il Consiglio di amministrazione è composto da rappresentanti eletti locali (Regione, Dipartimento e Città di Parigi). Vota le misure per garantire il corretto funzionamento della rete Île-de-France Mobilités e il suo progressivo ammodernamento.
Île-de-France Mobilités è composta da oltre 400 persone guidate da Laurent Probst, il suo CEO.